被視為2003年沙士的「抗疫英雄」、港大醫學院微生物學系講座教授袁國勇在疫情初期便獲委任為政府顧問之一，過去兩年其言論一直被視為政府政策「指標」，例如呼籲市民戴兩個口罩，更曾指拒絕接種疫苗「要過身」，又挺身抵擋社會對滅絕倉鼠的輿論壓力，再被視為新冠的抗疫英雄。不過由今年中起，其言論開始「緩和」，隨著他於9月初確診後，近日更直指新冠病毒不會如「沙士」般自然消失，相反地會如其他引起普通感冒的冠狀病毒般，繼續在社區傳播長存人間。
在2020年1月底疫情爆發初期，林鄭政府拒絕「封關」，直至武漢傳入首宗確診個案後，社會上要求封關的聲音越來越大，袁國勇當時就繼續為政府辯護，指現在做（封關）已沒有很大作用，呼籲全民戴口罩才是最有效方法，引發全城搶購口罩潮。
不過同年3月，袁國勇風向一轉，與同系名譽助理教授龍振邦於《明報》撰寫題為《大流行緣起武漢》文章，直斥「病毒是中國人劣質文化之產物，濫捕濫食野生動物、不人道對待動物、不尊重生命，為滿足各種欲望而繼續食野味，中國人陋習劣根才是病毒之源」。不過翌日隨即發聲明收回文章，指自己只是科學家，從來無意捲入政治，對「文章表達不適當，用詞甚至有錯誤，並非原意，希望外界不要將他們捲入政治，留給他們一個空間研究」。
袁國勇「過身」言論引起輿輪
自2020年1月起獲委任為政府顧問的袁國勇，其實其言行亦曾與政府政策「對著幹」，如2020年5月4日就曾表明拒絕接種疫苗，直言：「如果現在有疫苗要我打，我就不肯啦，仍然靠口罩會比較好。（若）一年之後有疫苗，等其他人打了先」。但在不足一年後，在政府公布疫苗接種計劃時呼籲各界打針，在各界均擔心疫苗副作用影響時，袁反指「應該考慮用一隻猛一啲，副作用多啲，但係保護力強啲（的疫苗），所以揀咗BioNTech」。同年年底的12月28日，袁國勇強稱過通關條件之一是必須推高疫苗接種率。
「如果唔肯打針，對唔住，物競天擇，你係要過身。」
袁國勇
2022年初漁護署銅鑼灣寵物店Little Boss一名女職員確診，加上抽取的倉鼠樣本對病毒呈陽性，決定人道處理上月22日後在市面售賣的倉鼠。事件再次引發社會輿論，當時袁國勇以專家身份為政府護航「最安全的方法唯有是忍痛犧牲倉鼠，以阻止這種可能來自倉鼠的Delta病毒株的爆發」。
今年9月袁國勇確診，但沒有病徵，他之後回覆傳媒表示自己情況良好，形容自己3年來可以稍為放假，休息數天也是好事。在復工後他研究進行研究工作，並連日發表文章，儘管確診數字仍然成千上萬，但日前袁國勇就聯同其他學者在網上媒體發表文章，題為《新冠疫情勢將盡，香港復常心所往》，形容新冠病毒已轉為較溫和的風土病，建議先讓已接種三劑新冠疫苗的市民，在戴口罩的前提下生活「復常」。
| 2020年5月4日 | 如果現在有疫苗要我打，我就不肯啦，仍然靠口罩會比較好。一年之後有疫苗，等其他人打先。 |
| 2020年12月14日 | 相信自己做的事 只使用自己研發的疫苗。 |
| 2021年3月6日 | 係應該考慮用一隻猛一啲，副作用多啲，但係保護力強啲（的疫苗），所以揀咗BioNTech。 |
| 2021年8月17日 | 唔好再諗免疫屏障，要全民打疫苗才可達至通關。 |
| 2021年12月28日 | 如果唔肯打針，對唔住，物競天擇，你係要過身。 |
| 2022年1月12日 | 未需要戴N95，可以考慮嘅，係可以戴兩個外科口罩，增加保護力。 |
| 2022年1月18日 | 最安全的方法唯有是忍痛犧牲倉鼠，以阻止這種可能來自倉鼠的Delta病毒株的爆發。 |
| 2022年7月16日 | 本港應於夏季逐步放寬社交距離措施，讓社區透過低度傳播產生自然感染，加上疫苗接種，產生「混合免疫」。 |
| 2022年9月8日 | 確診後，3年來可以放假也是好的，感謝大家關心。 |
| 2022年9月20日 | 本港絕對有條件進一步實現以檢測代替隔離之「0+7」方案，甚至更進取方案，加速邁向復常。 |
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